O Elite Clube Desportivo foi fundado em 1º de setembro de 1921. A posse da primeira diretoria foi em 30 de setembro, portanto, 102 anos atrás. Essa passou a ser a data oficial da fundação do clube.

O Elite era um time diversificado, formado por jogadores descendentes de várias etnias: alemães, italianos, poloneses, afrodescendentes, caboclos etc. A diretoria era predominantemente formada por elementos de origem europeia e o time era sustentado, principalmente, pelo Comércio do Povo Novo. 

A primeira sede estava situada na Farmácia Espíndola, em uma residência pertencente à família Schmidt, na Rua 3 de Outubro, sendo escolhido Frederico Schnepfleitner como o presidente.

O primeiro campo localizava-se na atual Praça Ricardo Leônidas Ribas (antiga Praça Rio Branco), terreno que fora cedido pela administração municipal daquela época. No início, eram elitenses, principalmente, os pertencentes às famílias Lied, Licht e Ferreira. 

No ano de sua fundação, o clube possuía uma banda de música, formada por 14 integrantes. O maestro regente, senhor Armindo, recebia mensalmente a fabulosa quantia de 300 mil réis. Também havia a orquestra do Elite, composta de três violinos, um pistão, um rebecão e pancadaria (hoje, chamamos de bateria).

O Elite Clube Desportivo foi campeão gaúcho (Série B) em 1958 e campeão da cidade em 1939, 1940, 1941, 1946, 1947, 1953, 1966 (Supercampeão) e 1968, além de ter conquistado a Taça Dia do Cronista (1953) e de ter sido a primeira equipe de Santo Ângelo a sair do país, na década de 1940, quando o clube alvinegro excursionou à Argentina.

O Elite também conquistou a Copa Arnaldo Balvé (1971). Na festa do primeiro ano do Elite, foi realizado um piquenique na chácara de Roberto Frey, no dia 7 de outubro de 1922.

Em 1989, ao lado do Grêmio Sportivo Santo-Angelense (também do ano de 1921) e do Tamoio Futebol Clube (fundado em 1944), formou a fusão que culminou na fundação da S.E.R. Santo Ângelo, clube que disputou a Série A do campeonato gaúcho de 1996 a 2004, além de ter sido campeão estadual de juniores (Série B) em 1993, campeão da Série C em 1995 e da Série B do campeonato gaúcho em 1996.